在巴州区，公司若想要保护其创新成果，专利注册是不可或缺的一环。以下是巴中商标注册代理总结的专利注册所需经历的主要流程：

一、专利明确类型

首先，公司需要明确自己所要申请的专利类型。根据《专利法》的规定，专利分为发明专利、实用新型专利和外观设计专利三种。公司应根据其创新成果的性质和市场需求，选择合适的专利类型进行申请。

二、检索同类型专利

在确定专利类型后，公司需要进行同类型专利的检索。这一步骤的目的是为了了解市场上是否存在与自己创新成果相似或相同的专利，避免侵权纠纷。公司可以自主检索，也可以委托专业的代理机构进行更全面的检索。

三、准备申请文件并提交

根据所选的专利类型，公司需要准备相应的申请文件。对于发明专利，需要提交请求书、说明书、摘要和权利要求书等文件；对于实用新型和外观设计专利，则需要提交请求书、图片或照片以及简要说明等文件。准备好文件后，公司需要按照规定的格式和程序提交给国家知识产权局。

四、受理与初步审查

提交申请后，国家知识产权局会对申请进行受理，并发出受理通知书。接着，会对申请进行初步审查，主要检查申请文件是否符合规定格式、是否齐全等。如果初步审查通过，会进入下一阶段；如果存在问题，则需要补正或重新提交。

五、公布与实质审查（特指发明专利）

对于发明专利申请，初审合格后还需要进行公布和实质审查。公布是为了让公众了解该发明的内容，并接受公众的监督和挑战。实质审查则是对专利申请是否具有新颖性、创造性、实用性以及是否符合专利法规定的其他实质性条件进行全面审查。如果审查通过，会进入授权阶段；如果存在问题，则需要修改或驳回。

六、授权与保护

经过以上步骤后，如果专利申请被授权，国家知识产权局会颁发专利证书并予以公告。此时，公司就拥有了该专利的专有权和保护权，可以在市场上享有独占的地位并排除他人的侵权行为。

在整个专利注册过程中，公司需要密切关注各个环节的进展情况，并及时处理可能出现的问题。同时，公司还应加强专利管理和保护意识，确保自己的创新成果得到充分的保护和应用。